ועדות אתיקה ברמת היחידה מקבלות הסמכה מהוועדה המוסדית לפעול במסגרת יחידות אקדמיות ספציפיות (מחלקות, פקולטות או בתי ספר), במטרה לגבש הנחיות ונהלים המותאמים למחקר הנערך באותה יחידה. על החוקרים לברר איזו ועדה ברמת היחידה אחראית למחקרם, ולפנות אליה כדי ללמוד על ההנחיות החלות על מחקר ביחידותיהם.