מפרויקט גמר בתואר הראשון לפרסום בכתב עת בינלאומי מוביל
כיצד מצליח ה-DNA שבתא להיות מאורגן כך שהוא גם נדחס למרחב זעיר בתוך גרעין התא, וגם נשאר נגיש לביצוע פעולות חיוניות כמו הפעלת גנים, שכפול ותיקון של ה-DNA? שאלה מדעית מרתקת זו עמדה במרכז פרויקט הגמר ההנדסי של הסטודנט לתואר ראשון, ים בן יעיש, במחלקה להנדסת ביוטכנולוגיה, שבוצע בהנחיית פרופ' רוני גרנק ובשיתוף הפוסטדוקטורנטית ד"ר סדהאנה סינג.
במחקר נמצא כי ניתן לתאר את המבנה וההתנהגות של ה-DNA באמצעות מודל פיזיקלי של שרשרת ארוכה וגמישה המתקפלת ונקשרת לעצמה באמצעות מספר קטן של מנגנונים בסיסיים. למרות פשטותו, המודל הצליח לשחזר בדיוק רב את דפוסי הארגון והתנועה שנצפו בניסויים, הן בתאים תקינים והן בתאים בעלי רמת אנרגיה נמוכה.
איכותו המדעית של המחקר זכתה להכרה בינלאומית, והוא התקבל לפרסום בכתב העת Biophysical Journal ואף נבחר להיות מוצג על שער כתב העת - הישג יוצא דופן עבור מחקר שבוצע במסגרת פרויקט הגמר ההנדסי לתואר ראשון.
בתמונה:
A simulated 3D chromatin polymer model of 10,000 Kuhn segments, exhibiting a lack of mixing and fractal globule organization. It is shown from two complementary perspectives (observation angles). The colors mark the genomic position from the polymer ends from start (blue) to end (red) (green and yellow are intermediate positions).
