מעבדת קהילות בתנועה עוסקת ביחסי הגומלין המתמשכים בין ישראל לבין קהילות יהודיות ברחבי העולם, המקומות מהם הגיעו חברי הקהילה לישראל ועיצבו את מאפייני החברה, ואת יחסי הגומלין שנותרו פעילים במדינות שונות בחו"ל.קידום חקר קהילות יהודיות ותרומתן לתרבות ולזהות הישראלית.