מהלך המחלה אינו קבוע, אך כ-90% מהסובלים מהמחלה יהנו מצמיחה מחודשת של שיער בשנה הראשונה, וזאת ספונטנית או בעזרת טיפולים רפואיים.
ככל שאזור המעורב קטן יותר - כך הסיכוי להחלמה מלאה טוב יותר.
כשליש מהחולים שסבלו מארוע של אלופציה אראטה יסבלו מהישנות המחלה במהלך חייהם.
הטיפולים הנפוצים ביותר לאלופציה אראטה הינם מריחה/הזרקה מקומית של תכשירים סטרואידליים נוגדי דלקת, אך טיפולים נוספים קיימים ונקבעים על פי חומרת המצב, תגובה לטיפולים קודמים ורצון המטופל ומשפחתו. לאחרונה נוספו לסל הבריאות טיפולים חדשים לטיפול במקרים הקשים של המחלה, כולל תרופות ממשפחת מעכבי ה-JAK.
