מטרת הקורס לבסס יסודות של חשיבה והבנה אבולוציוניים אצל תלמידי ביולוגיה. במהלך הקורס התלמידים ילמדו עקרונות מרכזיים באבולוציה תוך שימוש בדוגמאות ממחקרים קלאסיים וחדשים. הקורס יכלול תרגילים שבועיים בהם התלמידים ידונו ויתרגלו נושאים הנלמדים במהלך ההרצאות.

הנושאים העיקריים בהם יעסוק הקורס:

1. הקדמה: הדגמת החשיבות וההתפתחות תורת האבולוציה על הקשריה השונים.

2. המנגנונים והכוחות האבולוציוניים: הסינתזה המודרנית וגנטיקה של אוכלוסיות; השונות הגנטית; הברירה הטבעית; הגירה; סחיפה גנטית אקראית וכוחות אבולוציוניים אחרים.

3. ההיסטוריה של החיים: תהליכים המביאים להיווצרות חידושים אבולוציוניים, מינים חדשים, כולל ניתוח והבנה של תסריטים אבולוציוניים.

איפה ומתי?

הרצאות: יום א', 10:00-12:00, בניין 26 אולם 04

תרגילים:

קבוצה	יום	שעה	כיתה	מדריכ/ה
11*	ב'	08-10	בניין 34, חדר 3	חגי
12	ב'	12-14	בניין 32, חדר 110	ישראל
13	ג'	08-10	בניין 28, חדר 103	חגי
14	ד'	08-10	בניין 90, חדר 144	ישראל
15	ד'	10-12	בניין 28, מעבדה 305	ישראל
16	ד'	15-17	בניין 38, חדר 204	ישראל
17	ה'	08-10	בניין 34, חדר 3	חגי
18	ה'	10-12	בניין 90, חדר 242	חגי
19	ה'	14-16	בניין 90, חדר 139	חגי

התרגילים יתנהלו בכיתות הלימוד המצוינות ו/או בחדר המחשבים של המחלקה למדעי החיים (לפי הודעה מוקדמת).

* קבוצה לתלמידי ביואינפורמטיקה בלבד וללא-ביולוגים.

לוח זמנים (ייתכנו שינויים בנושאי ההרצאות ופרקי הקריאה במהלך הקורס - נא לעקוב ברציפות). שימו לב! הטבלא כוללת פירוט חובות הגשת הדו"חות.

לצרכי הקורס מספיקה בהחלט המהדורה השנייה של ספר הקורס. לנוחיותכם מפורטים כאן גם עמודי הקריאה הרלוונטיים במהדורה השלישית של הספר.

שבוע	תאריך הרצאה	נושא	עמודים לקריאה (מהדורה שנייה)	עמודים לקריאה (מהדורה שלישית)	הגשות דו"חות יש לשלוח לכתובת הזו בלבד	מטלות (בסה"כ יש 4 מטלות להגשה)
1	21 באוקטובר	מהי אבולוציה?	3-19	3-30		"נייר עמדה" ללימוד עצמי, לא להגשה
2	27 בינואר	עדויות לאבולוציה	21-45	35-65		אין מטלה
3	3 בפברואר	ברירה טבעית	47-71	69-104		Biomorphs ללימוד עצמי, לא להגשה
4	10 בפברואר	השונות הגנטית, אבולוציה של סקס וברירה מינית	75-105 213-224, 289-329	109-139 274-285 373-415		אחת מהמשימות הבאות: "ברירה מינית" או "סלקציה ומגוון גנטי" 5% מציון הקורס
5	17 בפברואר	גנטיקה של אוכלוסיות I: סלקציה ומוטציה	109-152	141-191
6	24 בפברואר	גנטיקה של אוכלוסיות II: סחיפה גנטית, הגירה ורבייה לא אקראית	155-193	195-250	הגשת דו"ח "ברירה מינית" או "סלקציה ומגוון גנטי" (עד 29 בפברואר)	אחת מהמשימות הבאות: "מוטציה וסלקציה" או "דריפט, הגירה וזיווגים לא אקראיים" 5% מציון הקורס
7	2 במרץ	תכונות כמותיות	549-584	727-766
8	9 במרץ	ספציאציה	403-437	583-613	הגשת דו"ח "מוטציה וסלקציה" או "דריפט, הגירה וזיווגים לא אקראיים" (עד 14 במרץ)	"ספציאציה" 15% מציון הקורס
9	16 במרץ	ספציאציה				אין מטלה
10	23 במרץ	פילוגנזה	437-462	550-581		"פילוגנזה" – 5% מציון הקורס
11	30 במרץ	הקמבריום ואילך	507-544	663-700	הגשת דו"ח "ספציאציה" (עד 4 באפריל, 2008). לנבחנים בביואינפורמטיקה (בלבד)- עד 8 באפריל.	אין מטלה
12	6 באפריל	התפתחות ואבולוציה	587-608	701-724	הגשת דו"ח "פילוגנזה" (עד 18 באפריל 2008)	אין מטלה

מבחן סופי:

6 במאי, 2008, 09:00. בניין 34 חדרים 2, 3, 9, 10, 102, 103.

משך המבחן: שלוש שעות.

חומר פתוח.

קשר למדריכים:

	טלפון	דוא"ל
ישראל וייס	050-4511540	*
חגי גוטרמן	052-5230248	*
מיכל גרונטמן דו"חות יש לשלוח לכתובת הזו בלבד	054-2199281	*
יפעת סגל	050-7234908	*

שעות קבלה של המתרגלים:

- מיכל: יום ב', 14:00-16:00, בניין 40 חדר 418.

- יפעת: יום ב', 12:00-14:00, בניין 40, חדר 306.

בתיאום מראש בלבד!

ספר הקורס:

Freeman, S. & Herron, J.C. (2001/3) Evolutionary Analysis, 2^nd or 3^rd editions, Prentice Hall, Upper Saddle River, NJ, USA.

לאתר המהדורה השלישית של הספר הכולל חומר עזר רב ומגוון

סימולציות נלוות לספר הקורס: http://faculty.washington.edu/herronjc/SoftwareFolder/software.html

מילוני מונחים: מלבד glossary בסוף ספר הקורס ניתן לברר משמעות מושגים שונים באתרים הבאים:

Glossary מוזיאון המאובנים מילוני מונחים שונים

ציון הקורס ומרכיביו:

דו"חות 0 עד 30% (מגן ולא חובה, ראו הסבר)

הערכת מדריך 5%

מבחן סופי 65% - 95% (חובה)

- חומר התרגילים והמטלות הוא חלק בלתי נפרד מחומר הקורס אולם הגשת הדו"חות על המטלות היא רשות.

- ציוני הדו"חות ישוקללו בציון הקורס במידה שיוגשו במועדם.

- אי הגשת אלו מהדו"חות תביא להגדלה פרופורציונאלית של משקל המבחן הסופי בציון הקורס.

- הממוצע המשוקלל של ציוני המטלות יהווה ציון מגן (לפי משקלו) לציון הקורס. לפיכך, הגשת מטלות לא יכולה להוריד את ציון הקורס.

לפיכך ועל פי בחירתכם, משקל הדו"חות ינוע בין 0 ו- 30% מציון הקורס ומשקל המבחן הסופי ינוע בהתאם בין 65% ל- 95% מציון הקורס.

בכדי לקבל את נקודות הזיכוי של הקורס יש לקבל הן בתרגיל והן במבחן הסופי ציונים מינימאליים של 56.

אודות המרצה:

אתר הבית של המרצה הכולל סקירה קצרה של תחומי מחקר ועניין.

קורסים אחרים של המרצה:

· פרויקט אישי באבולוציה – המחלקה למדעי החיים.

· אקולוגיהם אבולוציונית של גמישות התפתחותית - ביה"ס הבינלאומי ללימודי מדבר.

· Camp Evolution

חובות

· אין חובת נוכחות בהרצאות אך יש חובת נוכחות בתרגילים ובמעבדות. היעדרויות מתרגילים שלא בגין מילואים או מחלה (בצירוף אישורים מתאימים) עלולות להביא להורדת ציון ואף לביטול ההשתתפות בקורס.

· בקורס משתתפים תלמידים רבים. החומר רב ביותר ומופשט בעיקרו. נוכחות בהרצאות מותנית בהתנהגות הולמת.

· במהלך הקורס תתבקשו לבצע מגוון של מטלות עליהם תוכלו להגיש דו"חות. הגשת הדו"חות היא בזוגות בלבד. שינוי זוגות יעשה באישור בלעדי של המדריכים. שימו לב למספר הדו"חות שהינכם מגישים מכל קבוצת בחירה. יש להגיש את הדו"חות בזמנים הנקובים- לא יתקבלו דו"חות באיחור.

כיצד להצליח בקורס?

הצלחה והנאה מרביים בקורס יכולים להיות מבוססים על ההמלצות הבאות:

· התפקיד העיקרי של ההרצאה והתרגיל הוא לגרות אתכם ללמוד את החומר. עיקר הלימוד האמיתי נעשה באופן אישי ואינטימי בין התלמיד לבין עצמו ובינו לבין חבריו. החומר רב למדי ודורש השקעה של 5-8 שעות בשבוע. שימו לב!- אתם לא נבחנים על כמות הזמן המושקע אלא עפ"י רמת הבנתכם ושליטתכם בחומר.

· הקורס מבוסס באופן הדוק למדי על הספר שהינו עכשווי, ברור וכתוב בשפה מובנת במיוחד. אתר האינטרנט של הספר עשיר ומכיל חומר עזר רב וקישורים למקורות בנושאים הנלמדים.

· קראו את הפרקים הרלוונטיים לחומר הנלמד בספר לקראת השיעורים והתרגילים. אל תדחו הקריאה לסוף הקורס או לבחינה. החומר רב ומעניין- מעקב שוטף שלכם יבטיח הנאה ויקטין לחצים בסוף הקורס.

· מומלץ לרכוש את ספר הקורס- הוא ישמש אתכם בעתיד גם אם אינכם מרחיבים לימודים בנושאים אבולוציוניים מובהקים.

· עברו על השאלות המנחות המצורפות לכל פרק (באתר זה) ועל שאלות הסיכום בסופו של כל פרק בספר.

· בזמן ההרצאות והתרגילים השקיעו את תשומת הלב לרעיונות הנלמדים. כל השקופיות תהיינה זמינות באתר זה בסמוך למועד ההרצאות והתרגילים- אל תשקיעו זמן בהעתקה מהמסך!!

· במקרים רבים הראות בחלקים שונים של אולם ההרצאות עלולה להיות מוגבלת. מומלץ להגיע להרצאות עם העתקי השקופיות אותם ניתן להוריד מאתר זה בסמוך למועד ההרצאות. שימו לב!- במקרים רבים תוכן המצגות יכול להשתנות סמוך למועד ההרצאות גם במקרים בהם הן כבר נמצאות באתר.

· בררו עם המדריכים שאלות שעולות במהלך התרגילים והלימוד האישי שלכם. במקרים בהם אין למדריכים זמן להתייחס לשאלותיכם במהלך התרגילים הם יעשו זאת בתיאום עמכם בזמן קרוב אחר. לגבי נושאים לא מובנים אליהם לא יהיה זמן להתייחס בעת ההרצאות ניתן לשלוח למרצה שאלות בדוא"ל. כל שאלה תקבל התייחסות. תשובות לשאלות חשובות ועקרוניות תתפרסמנה אנונימית באתר זה.

· השתתפו בדיונים המתפתחים בתרגילים! איכות הלימוד בתרגילים תקבע על ידי רמת השתתפותכם (וגם- חלק מהציון מבוסס על רמת השתתפותכם והתרשמות המדריכים מכם).

· מומלץ מאוד להגיש דו"חות- למרות שהגשת הדו"חות על המטלות איננה חובה, החומר אליו הן מתייחסות הוא חלק בלתי נפרד מחומר הקורס עליו תבחנו במבחן הסופי. כמו כן, עבודה שוטפת על המטלות תקדם את הבנת החומר הנלמד וציוני הדו"חות יביאו, בהסתברות גבוהה, לשיפור הציון הסופי של הקורס.

· שימרו על ראש פתוח! הקורס עשיר ברעיונות תיאורטיים עקרוניים החוצים גבולות דיסציפלינריים וברוב המקרים הם חשובים בהרבה מהעובדות הנלמדות.

· המבחנים יתנהלו עם חומר פתוח. חשוב להבין את החומר ולא לנסות "לשלוף עובדות".

· סטודנטים עם צרכים מיוחדים (קשיי שפה, דיסלקציה וכו') יכולים ליצור קשר עם המדריכים מיד עם תחילת הקורס לקבלת עזרה.

· המדריכים יחזירו דו"חות בדוקים עם הערות בקשר לטיב העבודה. ניתן לברר נושאים הקשורים לבדיקת הדו"חות אך אין לנסות להתמקח על ציונים. ציוני הדו"חות והערכות המדריך ישוקללו בין המדריכים בסוף הקורס.

אתיקה:

בעצם ההרשמה לקורס הנכם מתחייבים לנהוג ביושר ולנהוג עפ"י הקוד האתי של אב"ג ובכללם הכללים הבאים:

· אין להעתיק עבודות, דו"חות או כל חומר מקורי אחר מתלמידים אחרים.

· האחריות על העתקה מוטלת הן על המעתיקים והן על בעלי החומר המקורי.

· הכללת קטעים או רעיונות שנמצאו בפרסומים שונים (בכתב או אלקטרונית) חייבים בציטוט מדויק של המקורות. במקרה בו נדרשת העתקת קטעים כלשונם הם יופיעו במירכאות תוך ציון מדויק ומלא של המקור (כולל שנה ומספרי עמודים, כנהוג בפרסום מדעי).

· שיתוף פעולה יכול להתקיים אך ורק ברשות המדריכים ולצורך הגשת עבודה משותפת לאותו מדריך.

· עברייני אתיקה יטופלו עפ"י נהלי אוניברסיטת בן-גוריון.

סיכומי הרצאות:

- שבוע 1: מהות האבולוציה: דוגמא (html). Power Point PDF

- שבוע 2: עדויות לקיום האבולוציה (html). Power Point PDF

- שבוע 3: ברירה טבעית (html). Power Point PDF

- שבוע 4: מוטציה ושונות גנטית (html). Power Point PDF

- שבוע 5: גנטיקה של אוכלוסיות I- סלקציה (html). Power Point PDF

- שבוע 6: גנטיקה של אוכלוסיות II- הגירה, סחיפה ועוד (html). Power Point PDF

- שבוע 7: גנטיקה כמותית (html) PDF Power Point

- שבוע -98: ספציאציה (html) Power Point PDF

- שבוע 10: פילוגנזה (html) Power Point PDF

- שבוע 11: הקמבריום ואילך (html) Power Point PDF

- שבוע 12: אבולוציה והתפתחות (html) Power Point PDF

תשובות לשאלות נבחרות של תלמידים:

אתם מוזמנים לשאול

תרגילים ומעבדות:

דו"חות יש לשלוח ל- כתובת זו בלבד

מצגות מעודכנות נוספות יפורסמו לפי התקדמות הקורס

שבוע	תאריך	דף תרגיל	מצגת מוקדמת	מצגת מסכמת	הערות	קריאה נוספת

1	21/10	מהות האבולוציה	מצגת תרגיל		לעבודה עצמית
2	27/1	עדויות לאבולוציה	עדויות לאבולוציה	מצגת התרגיל	--
3	3/2	ברירה טבעית	ברירה טבעית	מצגת התרגיל	לעבודה עצמית	ברירה מינית בג'ירף
4	10/2	סקס וברירה מינית	סקס וברירה מינית	מצגת התרגיל	אחת מתוך שתיים	העדפת בני זוג באדם
5	17/2	גנט' של אוכלוסיות: מוטציה וסלקציה	גנט' של אוכלוסיות I	מצגת התרגיל	אחת מתוך שתיים
6	24/2	תרגיל 6	גנט' של אוכלוסיות II	מצגת התרגיל	אחת מתוך שתיים	Templeton 2001
7	2/3	תרגיל 7	תכונות כמותיות	מצגת התרגיל	אחת מתוך שתיים
8	9/3	תרגיל 8	ברירת שארים	מצגת התרגיל	מטלה מורחבת
9	16/3	תרגיל 9	ספציאציה	מצגת התרגיל	--
10	23/3	תרגיל 10	עפ"י דף התרגיל		להגשה
11	30/3	תרגיל 11	אבולוציה של האדם	מצגת התרגיל	--
12	6/4	תרגיל 12	התפתחות	מצגת התרגיל	--

קישורים שונים:

כיום נמצאים באינטרנט אלפי אתרים מרתקים בנושאים הקשורים לאבולוציה. להלן קישורים, לאו דווקא מייצגים, לאתרים מועילים או מעניינים במיוחד. אשמח להוסיף קישורים לפי המלצותיכם.

סימולציות נלוות לספר הקורס: http://faculty.washington.edu/herronjc/SoftwareFolder/software.html

חיבוריו של דארווין ברשת, כולל את "מוצא המינים", "מסעי הביגל", "מוצא האדם" ועוד: http://www.literature.org/authors/darwin-charles/

המוזיאון הפליאונטולוגי של אונ' ברקלי, כולל סקירות לגבי התפתחות הרעיון האבולוציוני והרקע האבולוציוני של קבוצות טקסונומיות רבות: http://www.ucmp.berkeley.edu/history/evolution.html

פרוייקט "עץ החיים": מקור עצום לסיסטמטיקה, פליאונטולוגיה וכו' של קבוצות טקסונומיות רבות: http://tolweb.org/tree?group=Life&contgroup=

- חשוב!! חיפוש חומר במאגר Biosis

- "סדנת האבולוציה": הפקה מצוינת של רשות השידור האמריקנית (PBS): http://www.pbs.org/wgbh/evolution/shop/index.html

- הפקה מעולה של ה- BBC בנושאי אבולוציה: http://www.bbc.co.uk/education/darwin/index.shtml

- עולמו של ריצ'רד דאוקינס: http://www.world-of-dawkins.com/

- "יום דארווין: פעילויות חינוכיות בנושא אבולוציה: http://www.darwinday.org/

- אוספים גדולים של קישורים בנושאי אבולוציה:

http://www.anselm.edu/homepage/jpitocch/resevol.html

http://golgi.harvard.edu/BioLinks/Evolution.html

- סיכומי הרצאות של קורס באבולוציה מהאתר המחתרתי של תלמידי הביולוגיה של אוניברסיטת תל-אביב: היקף ועומק החומר בד"כ לא תואמים את הקורס שלנו. הסיכומים נכתבו על ידי התלמידים וכנראה ללא מעורבות המרצה, ד"ר ארנון לוטם- אין להסתמך על חומר זה כמקור מוסמך לצורך כלשהו.

- קראו את התקציר הבא!! קבוצה של חוקרים ישראלים מצאו פתרון עקרוני לבעיות הנובעות מביטוי של

מוטציית STOP (ראו הרצאה 4) כגון ציסטיק פיברוסיס ומחלות קשות אחרות.

- MHC והעדפת בני זוג באדם. חוש הריח האנושי עדיין חי קיים ו...בעל משמעות אבולוציונית!

- בעברית! כתבות בנושאים הקשורים לאבולוציה

- בעברית! דארווין והמאבק באבולוציה

- עיקור כפוי בשבדיה.

- לסדרת הרצאות בעברית (מאת פרופ' יואל רק, אונ' תל-אביב) על האבולוציה של האדם

- אומנות אנשי המערות מלפני 30,000 שנה

- נקודות למחשבה בנושא eugenics ומדע מתקדם.

- פיתוח זני חיטה חדשים והחשיבות של שימור זני הבר של מינים מתורבתים – שיעור על מחיר הסלקציה!

- האם "קיבלנו" את גודל המוח שלנו מהנאדרטאלים?

- גנים הקשורים לראייה והרחה התגלו ב...קיפודי ים