מטרת הקורס לבסס יסודות של חשיבה והבנה אבולוציוניים אצל תלמידי ביולוגיה. במהלך הקורס התלמידים ילמדו עקרונות מרכזיים באבולוציה תוך שימוש בדוגמאות ממחקרים קלאסיים וחדשים. הקורס יכלול תרגילים שבועיים בהם התלמידים ידונו ויתרגלו נושאים הנלמדים במהלך ההרצאות.

הנושאים העיקריים בהם יעסוק הקורס:

1. הקדמה: הדגמת החשיבות וההתפתחות תורת האבולוציה על הקשריה השונים.

2. המנגנונים והכוחות האבולוציוניים: הסינתזה המודרנית וגנטיקה של אוכלוסיות; השונות הגנטית; הברירה הטבעית; הגירה; סחיפה גנטית אקראית וכוחות אבולוציוניים אחרים.

3. ההיסטוריה של החיים: תהליכים המביאים להיווצרות חידושים אבולוציוניים, מינים חדשים, כולל ניתוח והבנה של תסריטים אבולוציוניים.

איפה ומתי?

הרצאה: יום א', 10:00-12:00, בניין 92 אודיטוריום 1

תרגילים:

קבוצה	יום	שעה	כיתה	מדריכ/ה
11	ב'	08-10	בניין 34, חדר 5	מירב וכט-כץ
12	ב'	10-12	בניין 34, חדר 5	מירב וכט-כץ
13	ב'	12-14	בניין 34, חדר 7	נדב שי
14	ד'	08-10	בניין 34, חדר 5	מירב וכט-כץ
15	ד'	10-12	בניין 34, חדר 5	מירב וכט-כץ
16	ה'	08-10	בניין 34, חדר 103	נדב שי
17	ד'	18-20	בניין 34, חדר 9	נדב שי

התרגילים יתנהלו בכיתות הלימוד המצוינות או, לפי הודעה מוקדמת- בחדר המחשבים של המחלקה למדעי החיים.

לוח זמנים (ייתכנו שינויים בנושאי ההרצאות ופרקי הקריאה במהלך הקורס - נא לעקוב ברציפות). שימו לב! הטבלא כוללת פירוט חובות הגשת הדו"חות.

לצרכי הקורס מספיקה בהחלט המהדורה השנייה של ספר הקורס. לנוחיותכם מפורטים כאן גם עמודי הקריאה הרלוונטיים במהדורה השלישית של הספר.

שבוע	תאריך הרצאה	נושא	עמודים לקריאה (מהדורה שנייה)	עמודים לקריאה (מהדורה שלישית)	הגשות / הערות	מטלות (בסה"כ יש 4 מטלות להגשה)
1	30 באוקטובר	מהי אבולוציה?	3-19	3-30		"נייר עמדה" ללימוד עצמי, לא להגשה
2	6 בנובמבר	עדויות לאבולוציה	21-45	35-65		אין מטלה
3	13 בנובמבר	ברירה טבעית	47-71	69-104		Biomorphs ללימוד עצמי, לא להגשה
4	20 בנובמבר	השונות הגנטית, אבולוציה של סקס וברירה מינית	75-105 213-224, 289-329	109-139 274-285 373-415		הגשה בזמן של אחת מהמשימות הבאות: "ברירה מינית" או "מגוון גנטי" תקנה ציון מגן על 5% מציון הקורס
5	27 בנובמבר	גנטיקה של אוכלוסיות I: סלקציה ומוטציה	109-152	141-191	הגשת דו"ח "ברירה מינית" (עד 2 בדצמבר 2011) או "מגוון גנטי" (עד 9 בדצמבר, 2011)
6	4 בדצמבר	גנטיקה של אוכלוסיות II: סחיפה גנטית, הגירה ורבייה לא אקראית	155-193	195-250		הגשה בזמן של אחת מהמשימות הבאות: "מוטציה וסלקציה" או "דריפט, הגירה וזיווגים לא אקראיים" תקנה ציון מגן על 5% מציון הקורס
7	11 בדצמבר	תכונות כמותיות	549-584	727-766	מבחן ביניים
8	18 בדצמבר	ספציאציה	403-437	583-613	הגשת דו"ח "מוטציה וסלקציה" או "דריפט, הגירה וזיווגים לא אקראיים" (עד 30 בדצמבר 2011)	"ספציאציה" 15% מציון הקורס
(9)	בשבוע 9 אין הרצאה	ספציאציה	403-437	583-613		"ספציאציה" 15% מציון הקורס
10	1 בינואר	ספציאציה				אין מטלה
11	8 בינואר	פילוגנזה	437-462	550-581	הגשת דו"ח "ספציאציה" (עד 13 בינואר 2012)	"פילוגנזה" – 5% מציון הקורס
12	15 בינואר	הקמבריום ואילך	507-544	663-700		אין מטלה
13	22 בינואר	התפתחות ואבולוציה	587-608	701-724	הגשת דו"ח "פילוגנזה" (עד 27 בינואר 2012)	אין מטלה

מבחן ביניים (על חומר ההרצאות והתרגילים בשבועות 1-5)

ב- 11 בדצמבר, 2011

משך הבחינה: שעה וחצי.

חומר פתוח אך ללא מחשבים.

מבחן סופי:

מועד א': יפורסם בהמשך

מועד ב': יפורסם בהמשך

משך המבחן: שלוש שעות.

חומר פתוח אך ללא מחשבים.

מדריכים:

	שעות קבלה (בתיאום מראש)	טלפון	דוא"ל
מירב וכט-כץ	יום ד' 12:00-14:00	052-3065149	*
שי נדב	יום ה' 15:00-17:00	052-3795402	*
יפעת אלהרר		050-8429305	*
אלישבע מורנו		050-5762962	*

ספר הקורס:

Freeman, S. & Herron, J.C. (2001/3/7) Evolutionary Analysis, 2^nd, 3^rd and 4^th editions, Prentice Hall, Upper Saddle River, NJ, USA.

סימולציות נלוות לספר הקורס: http://faculty.washington.edu/herronjc/SoftwareFolder/software.html

מילוני מונחים: מלבד glossary בסוף ספר הקורס ניתן לברר משמעות מושגים שונים באתרים הבאים:

Glossary מוזיאון המאובנים מילוני מונחים שונים

ציון הקורס ומרכיביו:

דו"חות 0 עד 30% (מגן ולא חובה, ראו הסבר)

הערכת מדריך 0 עד 5%

מבחן ביניים 15%

(חובה להשתתף, ציון שווה או נמוך מ- 69 יהווה 15% מציון הקורס; ציון גבוה מ- 69 יהווה ציון מגן עבור ציון הקורס בחלקיות של 15%).

מבחן סופי 50% - 80% (חובה)

- חומרי הלימוד של התרגילים והמטלות מהווים חלקים בלתי נפרדים מחומר הקורס אולם הגשת הדו"חות על המטלות היא רשות.

- ציוני הדו"חות ישוקללו בציון הקורס רק אם יוגשו במועדם.

- אי הגשת אלו מהדו"חות יביאו להגדלה פרופורציונאלית של משקל המבחן הסופי בציון הקורס.

- ציון כל אחת מהמטלות יהווה מגן (לפי משקלו) לציון הקורס. לפיכך, ציוני המטלות לא יכולים להוריד את ציון הקורס.

- ציון הערכת המדריך ישפיע על ציון הקורס רק במקרים מיוחדים של הצטיינות או בעייתיות. במקרים רגילים, ציון זה יהיה ניטראלי ולא ישפיע על הממוצע המשוקלל של מרכיבי הציון האחרים של הקורס.

- לפיכך ועל פי בחירתכם, משקל הדו"חות ינוע בין 0 לבין- 30% מציון הקורס ומשקל המבחן הסופי ינוע, בהתאם, בין 65% לבין- 95% מציון הקורס.

- בכדי לקבל את נקודות הזיכוי של הקורס יש לקבל במבחן הסופי ציון מינימאלי של 56. ציון נמוך יותר במבחן הסופי ימנע את שקלול מרכיבי הציון הנוספים ויחשב כציון הקורס הסופי.

אודות המרצה:

אתר הבית של המרצה הכולל סקירה קצרה של תחומי מחקר ועניין.

קורסים אחרים של המרצה:

· פרויקט אישי באבולוציה

· היבטים אקולוגיים ואבולוציוניים של גמישות פנוטיפית

· Camp Evolution

חובות

· אין חובת נוכחות בהרצאות אך יש חובת נוכחות בתרגילים ובמעבדות. היעדרויות מתרגילים שלא בגין מילואים או מחלה (בצירוף אישורים מתאימים) עלולות להביא להורדת ציון ואף לביטול ההשתתפות בקורס.

· הנוכחות בהרצאות מותנית בהגעה בזמן והתנהגות הולמת.

· במהלך הקורס תוכלו לבצע מגוון של מטלות עליהם תוכלו להגיש דו"חות. הגשת הדו"חות היא בזוגות בלבד. שינוי זוגות יעשה באישור בלעדי של המדריכים. שימו לב למספר הדו"חות שהינכם מגישים מכל קבוצת בחירה. יש להגיש את הדו"חות בזמנים הנקובים- לא יתקבלו דו"חות באיחור. הגשת הדו"חות תהיה אלקטרונית בלבד.

· השתתפות במבחן הביניים ובמבחן הסופי.

כיצד להצליח בקורס?

הצלחה והנאה מרביים בקורס יכולים להיות מבוססים על ההמלצות הבאות:

· דרך הלימוד: התפקיד העיקרי של ההרצאה והתרגיל הוא לגרות אתכם ללמוד משהו על אבולוציה.

o לימוד אמיתי יכול להיעשות רק באופן אישי ואינטימי ביניכם לבין עצמכם וחבריכם.

o החומר רב למדי ודורש מתלמיד אופייני השקעה של 5-8 שעות בשבוע.

· מקורות: הקורס מבוסס באופן הדוק למדי על הספר שהינו מעניין, ברור וכתוב בשפה מובנת במיוחד.

o מומלץ לרכוש את ספר הקורס- הוא ישמש אתכם בעתיד גם אם אינכם מרחיבים לימודים בנושאים אבולוציוניים מובהקים.

o אתר האינטרנט של הספר עשיר ומכיל חומר עזר רב וקישורים למקורות בנושאים הנלמדים.

o עברו על השאלות המנחות המצורפות לכל פרק ועל שאלות הסיכום בסופו של כל פרק בספר.

o רצוי לקרוא את הפרקים הרלוונטיים לחומר הנלמד לקראת השיעורים והתרגילים. אל תדחו הקריאה לסוף הקורס או לבחינה.

o החומר רב ומעניין- מעקב שוטף יבטיח הנאה ויקטין לחצים בסוף הקורס.

· הרצאות ותרגילים: בזמן ההרצאות והתרגילים השקיעו את תשומת הלב לרעיונות הנלמדים.

o כל השקופיות תהיינה זמינות באתר זה בסמוך למועד ההרצאות והתרגילים. למרות שסיכומים בכיתה יכולים לעזור להבנה ולריכוז, לא כדאי להשקיע בהעתקת החומר מהמסך.

o חשוב! המצגות אינן סיכומים של ההרצות. הן ה"פתקאות" והעזרים שלי לשמירת רצף והבהרת חלק מהנושאים. מניסיון- המצגות יכולות לעזור, אך לא להחליף את כל חומר הלימוד של הקורס. לפיכך, לימוד המבוסס על חומר המצגות בלבד יכול להיות מתסכל.

o במקרים רבים הראות בחלקים שונים של אולם ההרצאות מוגבלת וציוד ההקרנה מוגבל באיכותו. מומלץ להגיע להרצאות עם העתקי השקופיות אותם ניתן להוריד מאתר זה בסמוך למועד ההרצאות.

o שימו לב!- לעיתים, מצגות עשויות להשתנות בסמוך למועד ההרצאות גם במקרים בהם הן כבר נמצאות באתר. כמובן שעדכוני המצגות יפורסמו גם הם.

· בירורים ושאלות: בררו עם המדריכים שאלות שעולות במהלך התרגילים והלימוד האישי שלכם.

o במקרים בהם אין למדריכים זמן להתייחס לשאלותיכם במהלך התרגילים הם יעשו זאת בתיאום עמכם בזמן קרוב אחר (שימו לב לשעות הקבלה של המדריכים).

· השתתפות אקטיבית: השתתפו בדיונים המתפתחים בתרגילים!

o רמת השתתפותכם תקבע במידה רבה את איכות הלימוד בתרגילים וגם- חלק מהציון מבוסס על התרשמות המדריכים מהשתתפותכם.

o לצערנו, גודל הכיתה וקוצר בזמן לא מאפשרים לשלב בהרצאות דיונים רבים בהשתתפות אקטיבית של תלמידים (וחבל מאוד שכך!!) אבל-

o לגבי נושאים לא מובנים אליהם לא יהיה זמן להתייחס בעת ההרצאות ניתן לשלוח אלי שאלות בדוא"ל- כל שאלה תקבל התייחסות. תשובות לשאלות חשובות ועקרוניות תתפרסמנה אנונימית באתר זה.

· עבודות: למרות שאין חובת הגשה של דו"חות על המטלות, מומלץ מאוד להגישם.

o חומר המטלות בלתי נפרד מחומר הקורס עליו תבחנו במבחן הסופי.

o עבודה שוטפת על המטלות תקדם את הבנת החומר הנלמד וציוני הדו"חות יביאו, בהסתברות גבוהה מאוד, לשיפור הציון הסופי של הקורס.

o המדריכים יחזירו דו"חות בדוקים עם הערות בקשר לטיב העבודה. ניתן לברר נושאים הקשורים לבדיקת הדו"חות אך אין להתמקח על ציונים.

o ציוני הדו"חות והערכות הניתנים ע"י מדריכים שונים משוקללים בסוף הקורס.

· J שימרו על ראש פתוח! הקורס עשיר ברעיונות תיאורטיים עקרוניים החוצים גבולות דיסציפלינאריים וברוב המקרים הם חשובים בהרבה מהעובדות הנלמדות.

o חלקים של החומר נוגעים בנושאים בהם עסקתם בקורסים קודמים אולם מכיוונים שונים מאלה שרובכם מכירים. מניסיון: סטודנטים שפתוחים לכיוונים חדשים אלה מתעניינים ונהנים יותר מהקורס מאלה שמניחים כי הם כבר שמעו ויודעים הכול מקודם...

· מבחנים: למרות ששאלות המבחן במפורש לא מנסות להכשיל או להתחכם, תשובות נאותות דורשות הבנה ולא "שליפת עובדות".

o אתם לא נבחנים על זיכרון מחודד של עובדות ספציפיות ולכן המבחנים יתנהלו עם חומר פתוח.

o בדיקת המבחנים נעשית באופן פרטני, סלחני ומתוך התייחסות לאינטרפרטציות אפשריות שונות של השאלות.

o בכדי למנוע ויכוחים על ציונים ולפנים משורת הדין- ציון הבחינה כולל מספר נקודות נוספות (לא "פקטור") מעל הציון המגיע.

o זכרו- לפי כללי האוניברסיטה, ערעורים על ציונים מותרים בהחלט אך יביאו ל- א) מחיקת הנקודות העודפות שניתנו בבדיקה הראשונית; ב) בדיקה מחודשת וקפדנית של כל שאלון הבחינה.

· צרכים מיוחדים: סטודנטים עם צרכים מיוחדים (קשיי שפה, דיסלקציה וכו') מוזמנים ליצור קשר עם המדריכים לקבלת עזרה מיד עם תחילת הקורס.

אתיקה:

בעצם ההרשמה לקורס הנכם מתחייבים לנהוג ביושר ולנהוג עפ"י הקוד האתי של אב"ג ובכללם הכללים הבאים:

· אין להעתיק עבודות, דו"חות או כל חומר מקורי אחר ממקורות חיצוניים או מתלמידים אחרים.

· האחריות על העתקה מוטלת הן על המעתיקים והן על בעלי החומר המועתק.

· הכללת קטעים או רעיונות שנמצאו בפרסומים שונים (בכתב או אלקטרונית) חייבים באזכור מדויק של המקורות. במקרה בו נדרשת העתקת קטעים כלשונם הם יופיעו במירכאות תוך ציון מדויק ומלא של המקור (כולל שנה ומספרי עמודים, כנהוג בפרסום מדעי).

· שיתוף פעולה בין תלמידים יכול להתקיים אך ורק בתאום וברשות המדריכים ורק לצורך הגשת עבודה משותפת לאותו מדריך.

· עברייני אתיקה יטופלו עפ"י נהלי אוניברסיטת בן-גוריון.

מצגות ההרצאות:

- השנה אנו מנסים להקליט את ההרצאות.

להלן המצגות בפורמטים שונים:

- שבוע 1: מהות האבולוציה: דוגמא (html). Power Point PDF

- שבוע 2: עדויות לקיום האבולוציה (html). Power Point PDF

- שבוע 3: ברירה טבעית (html). Power Point PDF

- שבוע 4: מוטציה ושונות גנטית (html). Power Point PDF

- שבוע 5: גנטיקה של אוכלוסיות I- סלקציה (html). Power Point PDF

- שבוע 6: גנטיקה של אוכלוסיות II- הגירה, סחיפה ועוד (html). Power Point PDF

- שבוע 7: גנטיקה כמותית (html) PDF Power Point

- שבועות - 108: ספציאציה (html) Power Point PDF

- שבוע 11: פילוגנזה (html) Power Point PDF

- שבוע 12: הקמבריום ואילך (html) Power Point PDF

- שבוע 13: אבולוציה והתפתחות (html) Power Point PDF

תשובות לשאלות נבחרות של תלמידים:

אתם מוזמנים לשאול!

תרגילים ומעבדות:

מצגות מעודכנות נוספות יפורסמו לפי התקדמות הקורס

שבוע	תאריך (הרצאה שבועית)	דף תרגיל	מצגת מוקדמת	מצגת מסכמת		הערות	קריאה נוספת

1	30/10	מהות האבולוציה	HIV		מצגת התרגיל	לא לקרדיט
2	6/11	עדויות לאבולוציה	עדויות לאבולוציה	מצגת התרגיל		--
3	13/11	ברירה טבעית	ברירה טבעית	מצגת התרגיל		לא לקרדיט	ברירה מינית בג'ירף
4	20/11	סקס וברירה מינית	סקס וברירה מינית	מצגת התרגיל		להגשה: אחת מתוך שתיים	העדפת בני זוג באדם
5	27/11	גנט' של אוכלוסיות: מוטציה וסלקציה	גנט' של אוכלוסיות I	מצגת התרגיל		להגשה: אחת מתוך שתיים
6	4/12	תרגיל 6	גנט' של אוכלוסיות II	מצגת התרגיל		להגשה: אחת מתוך שתיים	Templeton 2001
7	11/12	תרגיל 7	תכונות כמותיות	מצגת התרגיל		להגשה: אחת מתוך שתיים
8	18/12	תרגיל 8	ברירת שארים	מצגת התרגיל		להגשה- מורחבת
9	25/12	תרגיל 9	ספציאציה	מצגת התרגיל		--
10	1/1	תרגיל 10	אבולוציה של האדם	מצגת התרגיל		להגשה
11	8/1	תרגיל 11	אין מצגת עבור סימולציות פילוגנזה			--
12	15/1	תרגיל 12	הכחדות	מצגת התרגיל		--
13	22/1	תרגיל 13	אבולוציה והתפתחות	מצגת התרגיל

קישורים שונים (אנא דווחו על תקלות בקישורים):

כיום נמצאים באינטרנט אלפי אתרים מרתקים בנושאים הקשורים לאבולוציה. להלן קישורים, לאו דווקא מייצגים, לאתרים מועילים או מעניינים במיוחד. אשמח להוסיף קישורים לפי המלצותיכם.

סימולציות נלוות לספר הקורס: http://faculty.washington.edu/herronjc/SoftwareFolder/software.html

חיבוריו של דארווין ברשת, כולל את "מוצא המינים", "מסעי הביגל", "מוצא האדם" ועוד: http://www.literature.org/authors/darwin-charles/

המוזיאון הפליאונטולוגי של אונ' ברקלי, כולל סקירות לגבי התפתחות הרעיון האבולוציוני והרקע האבולוציוני של קבוצות טקסונומיות רבות: http://www.ucmp.berkeley.edu/history/evolution.html

פרוייקט "עץ החיים": מקור עצום לסיסטמטיקה, פליאונטולוגיה וכו' של קבוצות טקסונומיות רבות: http://tolweb.org/tree?group=Life&contgroup=

- חשוב!! חיפוש חומר במאגר Biosis

- "סדנת האבולוציה": הפקה מצוינת של רשות השידור האמריקנית (PBS): http://www.pbs.org/wgbh/evolution/shop/index.html

- עולמו של ריצ'רד דאוקינס: http://www.world-of-dawkins.com/

- "יום דארווין: פעילויות חינוכיות בנושא אבולוציה: http://www.darwinday.org/

- אוספים גדולים של קישורים בנושאי אבולוציה:

http://www.anselm.edu/homepage/jpitocch/resevol.html

- סיכומי הרצאות של קורס באבולוציה מהאתר המחתרתי של תלמידי הביולוגיה של אוניברסיטת תל-אביב: היקף ועומק החומר בד"כ לא תואמים את הקורס שלנו. הסיכומים נכתבו על ידי התלמידים וכנראה ללא מעורבות המרצה, ד"ר ארנון לוטם- אין להסתמך על חומר זה כמקור מוסמך לצורך כלשהו.

- קראו את התקציר הבא!! קבוצה של חוקרים ישראלים מצאו פתרון עקרוני לבעיות הנובעות מביטוי של

מוטציית STOP (ראו הרצאה 4) כגון ציסטיק פיברוסיס ומחלות קשות אחרות.

- MHC והעדפת בני זוג באדם. חוש הריח האנושי עדיין חי קיים ו...בעל משמעות אבולוציונית!

- אומנות אנשי המערות מלפני 30,000 שנה

- נקודות למחשבה בנושא eugenics ומדע מתקדם.

- התגלתה צורת מעבר חדשה הקשורה למעבר לחיים מחוץ למים!

- למתקשים בקריאה..: תכנית רדיו (NPR) בקשר להשפעה המכריעה של החימום הגלובלי על הכחדות מינים