נאוה פליסקין פרשה כפרופסור מן המניין עם קתדרה מהמחלקה להנדסת תעשיה וניהול באוניברסיטת בן- גוריון בנגב, שם גם שמשה כראש התוכנית האקדמית בקורס טיס. בשנת הלימודים 1996-1997 היא שימשה כפרופסור אורח עם קתדרה בבית הספר למנהל עסקים של אוניברסיטת הרווארד. המחקר שלה התמקד בניהול מערכות מידע ברמת הארגון וברמת הפרט ופורסם בכתבי עת כגון: Journal of the Association for Information Systems, Information Systems Management, Information & Management, and Decision Support Systems, Database for Advances in Information Systems, Information Technology and Tourism. מאז פרישתה היא מלמדת בהתנדבות קורס לתארים מתקדמים: אימון בכתיבה אקדמית.
